docker中安装Python和R语言，并指定版本和R包 最近开发的一个项目，用到了R语言脚本。因为开发环境版本是4.4.2，所以生产环境也要装4.4.2。本来是这样写的，R语言版本指定不了。不管怎么写版本号 r-base=xxx 都安装不上，说不存在。# 安装R语言环境（默认是安装的4.2，但是我要装4.4） RUN apt-get update && apt-get install -y \ --fix-missing \ r-base \ r-cran-devtools \ build-essential \ libcurl4-openssl-dev \ libssl-dev \ libxml2-dev && \ rm -rf /var/lib/apt/lists/*搞不懂，换个思路，直接下载4.2.2版本安装# 使用 python 3.12 作为基础镜像 FROM python:3.12 # 设置工作目录 WORKDIR /app # 安装系统依赖和编译工具 RUN apt-get update && apt-get install -y --no-install-recommends \ build-essential \ wget \ libcurl4-openssl-dev \ libssl-dev \ libxml2-dev \ ca-certificates \ gfortran \ && rm -rf /var/lib/apt/lists/* # 下载并安装 R 4.4.2 源代码 RUN wget https://cran.r-project.org/src/base/R-4/R-4.4.2.tar.gz && \ tar -xvzf R-4.4.2.tar.gz && \ cd R-4.4.2 && \ ./configure && \ make && \ make install && \ cd .. && rm -rf R-4.4.2 R-4.4.2.tar.gz \ R --version # 设置 CRAN 镜像源为清华镜像并安装 R 包 RUN echo "options(repos = c(CRAN = 'https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/'))" > /usr/local/lib/R/etc/Rprofile.site && \ Rscript -e "install.packages('pheatmap')" && \ Rscript -e "install.packages('BiocManager')" && \ echo "options(BioC_mirror = 'https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor')" >> /usr/local/lib/R/etc/Rprofile.site && \ Rscript -e "BiocManager::install(version = '3.20')" && \ Rscript -e "BiocManager::install(c('GEOquery', 'ggplot2', 'readxl', 'readr', 'openxlsx', 'dplyr', 'clusterProfiler', 'limma', 'DESeq2'), ask = FALSE)" # 进入容器 # 查看R的安装目录：which R # 查看R版本：R --version 或 Rscript -e "R.version$version.string" # 查看R镜像：Rscript -e "print(getOption('repos'))" # 查看BiocManager版本： Rscript -e "packageVersion("BiocManager")" （BiocManager包的版本号。根据你当前的环境，它可能是通过 CRAN 安装的版本，通常在 1.x 系列） # 查看Bioconductor版本： Rscript -e "BiocManager::version()" （Bioconductor的版本。BiocManager 会根据你所安装的 Bioconductor 版本返回一个版本号。Bioconductor 的版本通常是以 3.x 开头的，例如 3.20。Bioconductor 版本是根据 R 版本来决定的，与 CRAN 上的 BiocManager 版本号是分开的。） # 查看BiocManager镜像： Rscript -e "options('BioC_mirror')" # 将当前目录的内容复制到容器中 COPY . /app # 安装 Python 项目所需的依赖 RUN pip install --no-cache-dir -r requirements.txt -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple